首先移植之后的早期一些并發癥可以出現：第一是與預處理相關的一些急性的毒副作用，比如口腔潰瘍和急性胃腸道感染等。第二見于一些出血性的膀胱炎。第三見于彌漫性的肺泡出血綜合征。第四就是各種感染。第五就是血栓性的微血管病。第六見于移植物的抗宿主病。晚期的并發癥主要包括哪些呢，就是有皮膚黏膜色素消失以及沉著，還有腺體分泌功能減退，白內障，白質腦病，生長發育障礙，還有內分泌障礙，另外還可以繼發一些惡性腫瘤。
      

      骨髓移植還是有一定的副作用的，醫學上稱為并發癥。骨髓移植常見的并發癥，包括預處理藥物的毒性作用，并發感染，以及移植物抗宿主病等。另外骨髓移植還可能會影響病人的心理狀況。