病情嚴重的腦炎后遺癥患者需要在重癥監護室進行治療。針對腦炎后遺癥的對癥治療包括氧療，吸痰，治療癲癇發作，降低顱內壓。恢復期應進行康復治療，推拿按摩會功能訓練。
      

      腦炎后遺癥是由于腦炎治療后，還殘留有神經、精神癥狀的疾病。。一般治療本病需要病程中應加強護理，防止褥瘡發生。要供給一定的水分、營養及電解質。對出現精神癥狀的病兒要防止發生意外。觀察是否出現腦疝的先兆。給予抗病毒治療，其他系統受累時，如心肌炎、肺炎等應及時處理。病后遺留的后遺癥可采用針灸、推拿、藥物及訓練等方法治療。