尖銳濕疣的治療方法很多，包括局部藥物治療（足葉草毒素酊，酞丁胺霜劑，氟尿嘧啶，咪喹莫特），物理療法（CO，激光治療，光動力治療，液氮冷凍），手術治療（淺表剪除、切除、刮除或電外科），全身療法（干擾素、IL一2和抗病毒藥物），免疫治療（自體活菌疫苗免疫療法，干擾素，HPV疫苗），中藥治療等。方法雖然很多，不過沒有一種能保證百分百治愈。治療同時，注意患者是否同時有淋球菌、衣原體、支原體、滴蟲、霉菌等病原體感染，如有應同時治療。患者配偶與性伴若有尖銳濕疣或其他性病，應同時治療。治療期間避免性生活。
